Seit 2010 vermahlt die Stiftsbäckerei ihr Roggenmehl selbst und nutzt dazu den Strom aus der eigenen Wasserkraft. Dazu hat Franz Grabmer eine Kombination aus 3 Mühlsteinen mit Siebmaschinen entworfen. Das verhindert im Gegensatz zur Vermahlung in einem Durchgang die Erwärmung des Mahlguts, wodurch wertvolle Inhaltsstoffe erhalten bleiben. Die Förderung der Mahlprodukte erfolgt in hygienischer Weise pneumatisch. Ein Teil der Mühle, der größte Mühlstein, ist im Vorraum der Bäckerei zu sehen.

Das mit hochmodernen Maschinen gereinigte Getreide wird weiterhin über die Stifts- und Salzachmühle bezogen.